Le réseau ISSN comprend le Centre international et les Centres nationaux ISSN. La coopération et la coordination formelles au sein du réseau sont déterminées par :

• les Statuts du Centre international
• les accords passés entre le Centre international et les Centres nationaux
• les décisions prises par le Conseil d'administration et l'Assemblée Générale
• la réunion annuelle des Directeurs de Centres où sont débattus les problèmes techniques et les sujets concernant la coordination et la communication.